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Ribo-seq 数据质控研究-中
一生太短 一生好长
1引言
今天复现出下面这张图右边,当然也是 ribotsh 软件的质控结果:
展示的是不同 reads 长度的,三个 frame 与 start codon 和 stop codon 在不同距离的比例。 当然这张图也能显示出明显的 3nt
周期性 (Periodicity)。
2探索
我们需要每个转录本的 start codon 和 stop codon 的位置信息,数据还是上次分析出来的的df
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